Можно ли изменить постоянные ссылки записей в группах на тип ссылок /%postname%.html

Здравствуйте.

Это обычная работа вордпресс. Не важно группы у вас или вукомерц (тип записи) - это же не является проблемой вукомерца что ВП так задает? Поэтому и для дополнения групп также.

Как настраивать редиректы и избавляться от такого поведения вордпресс - я думаю в сети рецепты есть. Поломают они что-то? Я не знаю.

Но вопрос - вам оно зачем? Миллионы живут так. Вы сео начитались?
В урл сейчас мало кто заглядывает. На почти всех устройствах урл спрятан пока специально его не откроешь. Да и современным домохозяйкам это ничего не говорит

Здесь стоит позвать Игоря - @garry

Он наверняка знает все подводные камни если посттайп прятать.
Наверняка будут проблемы с дублями на уровне движка - когда и группа может называться auto и например сторонняя запись или чужой post type с таким же слагом будет или запись в ней.

Не зря сам вордпресс такую иерархию делает.
А для сео - я увы не знаю принесет это пользу. Думаю что лучше правильно настроить сео плагин - нужные канонические ссылки расставить или запреты индексирования...

Как выше написал Владимир, сделать можно, но и проблемы он описал.
В плане seo бонуса вы не получите однозначно, удалив иерархию из ссылки групп.
Все такие манипуляции, скажем так, нужны и приятны глазу самого владельца сайта, на этом их полезность заканчивается.))